RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618511.4

RDM1-222, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 518 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-222	ENST00000618511	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	C2orf72	A6NCS6	295 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	USP17L3	A6NCW0	530 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	USP17L4	A6NCW7	530 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511		F6X3S4	739 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	RAD17	O75943	681 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	DACT2	Q5SW24	774 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	PPP1R37	O75864	691 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	IL1R1	P14778	569 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	FKBP1B	P68106	108 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	CHRND	Q07001	517 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	UBE4A	Q14139	1066 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	CST9	Q5W186	159 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	USP17L8	P0C7I0	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	MAP2K2	P36507	400 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	ECE1	P42892	770 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	MTX1	Q13505	466 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	USP44	Q9H0E7	712 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	WBP1L	Q9NX94	342 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	UNCX	A6NJT0	531 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	CA12	O43570	354 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	VEGFB	P49765	207 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	HTRA3	P83110	453 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	SUCLG2	Q96I99	432 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	CD209	Q9NNX6	404 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-222	ENST00000618511	CACNA1F	O60840	1977 aa		7.4	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	PCNT	O95613	3336 aa		7.4	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	CIAO1	O76071	339 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	EGFR	P00533	1210 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	FGFR2	P21802	821 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	MRI	Q9BWK5	157 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	SHTN1	A0MZ66	631 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	TRAF5	O00463	557 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	SASH1	O94885	1247 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	KLRK1	P26718	216 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	NOG	Q13253	232 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	IFFO2	Q5TF58	517 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RDM1-222	ENST00000618511	SULF1	Q8IWU6	871 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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