RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 NCOA7Q8NI08 942 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 KIFAP3Q92845 792 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 KIF1BO60333 1816 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 MYH10P35580 1976 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 GRIN2BQ13224 1484 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
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PTPRT-209ENST00000612229 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 I3L4J1 428 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 LGSNQ5TDP6 509 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 NRBF2Q96F24 287 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 NEK1Q96PY6 1258 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 PDE4BQ07343 736 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 GEN1Q17RS7 908 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 TMTC2Q8N394 836 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 DEUP1Q05D60 604 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GW55 424 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 STARD3NLO95772 234 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 DUX4Q9UBX2 424 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 F13A1P00488 732 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 KRT13P13646 458 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 MAP2K2P36507 400 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 USP16Q9Y5T5 823 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
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PTPRT-209ENST00000612229 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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PTPRT-209ENST00000612229 KRT23Q9C075 422 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.83□□□□□ -1.16
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PTPRT-209ENST00000612229 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 IFT20Q8IY31 132 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC42Q96M95 316 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 PIK3R4Q99570 1358 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP2AO43633 222 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP4BP1P59074 171 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 LMNB2Q03252 620 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 GTF3C6Q969F1 213 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 PANK2Q9BZ23 570 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 PFDN6O15212 129 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 BRAPQ7Z569 592 aa7.82□□□□□ -1.16
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PTPRT-209ENST00000612229 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 EVI5O60447 810 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 PARP2Q9UGN5 583 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFAB1O14561 156 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 SLC8A1P32418 973 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 NEK11Q8NG66 645 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 CABP1Q9NZU7 370 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRT-209ENST00000612229 PYGLP06737 847 aa7.81□□□□□ -1.16
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