RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609445.5

SGMS1-209, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-209ENST00000609445 CSRNP1Q96S65 589 aa20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-209ENST00000609445 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-209ENST00000609445 UTYO14607 1347 aa20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-209ENST00000609445 MMP14P50281 582 aa20.2■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.2■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 RNF186Q9NXI6 227 aa20.2■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 TRPA1O75762 1119 aa20.19■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 PRKG1Q13976 671 aa20.19■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 DLGAP5Q15398 846 aa20.19■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.19■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 NF2P35240 595 aa20.18■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 GYG1P46976 350 aa20.18■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.18■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 PTPRCP08575 1304 aa20.18■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 UBE4AQ14139 1066 aa20.17■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 CFAP100Q494V2 611 aa20.17■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.17■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.17■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 AOX1Q06278 1338 aa20.17■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 DGKZQ13574 1117 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 LRRC24Q50LG9 513 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 FZD1Q9UP38 647 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 CLRN2A0PK11 232 aa20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 USP44Q9H0E7 712 aa20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.15■□□□□ 0.82
SGMS1-209ENST00000609445 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 SPDYE6P0CI01 402 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.13■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.13■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.13■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 METTL24Q5JXM2 366 aa20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 VEZTQ9HBM0 779 aa20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 MYO1BO43795 1136 aa20.1■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 GRIK5Q16478 980 aa20.1■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.1■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.1■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 PDE8BO95263 885 aa20.09■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 TBC1D8O95759 1140 aa20.09■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.09■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 VPS37DQ86XT2 251 aa20.08■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.08■□□□□ 0.81
SGMS1-209ENST00000609445 TM4SF4P48230 202 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 RASA3Q14644 834 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 SPRYD7Q5W111 196 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 CCER2I3L3R5 266 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 BCAMP50895 628 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 MAP3K11Q16584 847 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 OTOFQ9HC10 1997 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 FGFR2P21802 821 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 CRKP46108 304 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 EYA2O00167 538 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 SREBF2Q12772 1141 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-209ENST00000609445 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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