RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHA10Q5JZY3 1008 aa32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SSC5DA1L4H1 1573 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 F8W031 263 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 IL1R1P14778 569 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRYD7Q5W111 196 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR14Q8NCE2 650 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 LMBR1LQ6UX01 489 aa32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF804AQ7Z570 1209 aa32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CFHR5Q9BXR6 569 aa32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 JAG2Q9Y219 1238 aa32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 AOX1Q06278 1338 aa32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP100Q494V2 611 aa32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CLRN2A0PK11 232 aa32.58■■■□□ 2.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYE2BA6NHP3 402 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYE6P0CI01 402 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K11Q16584 847 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA1FO60840 1977 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 GRM8O00222 908 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC57Q2TAC2 916 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CLMNQ96JQ2 1002 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PLIN1O60240 522 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 FKTNO75072 461 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF7LQ5H9L4 462 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC10A4Q96EP9 437 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CNNM1Q9NRU3 951 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO1BO43795 1136 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 WNK4Q96J92 1243 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 VEZTQ9HBM0 779 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH1A1P00352 501 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNL1Q8IU54 200 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ECM29Q5VYK3 1845 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP32.49■■■□□ 2.797e-9■■■□□ 16.3
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP32.49■■■□□ 2.792e-8■■■□□ 16.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM205AQ6ZU69 1335 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 INHBEP58166 350 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 RASA3Q14644 834 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC4A10Q6U841 1118 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ANP32CO43423 234 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH1L1O75891 902 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 GYG1P46976 350 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SUCLG2Q96I99 432 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 USP2O75604 605 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 GJA5P36382 358 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD14BQ5SR56 506 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 KAZALD1Q96I82 304 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 UNCXA6NJT0 531 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE4AQ14139 1066 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-211ENST00000590874 IREB2P48200 963 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYE2Q495Y8 402 aa32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMB1P07942 1786 aa32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA10Q9UK55 444 aa32.42■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM17Q9Y577 477 aa32.42■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 CDAN1Q8IWY9 1227 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 OTOP1Q7RTM1 612 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFAIP1Q13829 316 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 TEPSINQ96N21 525 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-211ENST00000590874 UTYO14607 1347 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CRHR2Q13324 411 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN18Q99952 460 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ELP3Q9H9T3 547 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ARAP2Q8WZ64 1704 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 MROH5Q6ZUA9 1318 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CRKP46108 304 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIK5Q16478 980 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM9BQ8IZU0 186 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 OTOFQ9HC10 1997 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 OPTNQ96CV9 577 aa32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms