RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587775.1

TMUB2-208, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, human

TSL 3

Gene TMUB2, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMUB2-208	ENST00000587775	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMUB2-208	ENST00000587775	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TMUB2-208	ENST00000587775	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMUB2-208	ENST00000587775	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMUB2-208	ENST00000587775	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMUB2-208	ENST00000587775	HAUS7	Q99871	368 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMUB2-208	ENST00000587775	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	ECE2	O60344	883 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	ABCB7	O75027	752 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	IGSF3	O75054	1194 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	CXCL9	Q07325	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	GRIK5	Q16478	980 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	GPR162	Q16538	588 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	ZAP70	P43403	619 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	KCNJ4	P48050	445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	POTEC	B2RU33	542 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	PSMD14	O00487	310 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	GTF2I	P78347	998 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	DPF2	Q92785	391 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	MXD3	Q9BW11	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	ERC2	O15083	957 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	CHGB	P05060	677 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	SDS	P20132	328 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	PRDX5	P30044	214 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	RNF181	Q9P0P0	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMUB2-208	ENST00000587775	RAD17	O75943	681 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	MMP14	P50281	582 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	SCNN1D	P51172	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	GPC2	Q8N158	579 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	GAK	O14976	1311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMUB2-208	ENST00000587775	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.13	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms