RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 ZIC5Q96T25 663 aa18.86■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.86■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 MAP2K2P36507 400 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 RGMBQ6NW40 437 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 DLGAP5Q15398 846 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 MOB2Q70IA6 237 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 TSKSQ9UJT2 592 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 KIF16BQ96L93 1317 aa18.83■□□□□ 0.61
CTIF-203ENST00000587752 CAPN15O75808 1086 aa18.83■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 VPS37DQ86XT2 251 aa18.83■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.83■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 BCAR3O75815 825 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 PDE8BO95263 885 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 MMP14P50281 582 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 NOGQ13253 232 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 CFAP100Q494V2 611 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 VGLL2Q8N8G2 317 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 MEIS3Q99687 375 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 SIL1Q9H173 461 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 TNNQ9UQP3 1299 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 EYA2O00167 538 aa18.81■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.62e-7■■■□□ 17.6
CTIF-203ENST00000587752 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.81■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.81■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 CLRN2A0PK11 232 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 BCAMP50895 628 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 PRKG1Q13976 671 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 CCDC102AQ96A19 550 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 AOX1Q06278 1338 aa18.79■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.79■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 SLC10A3P09131 477 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 SPDYE6P0CI01 402 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 TRIM27P14373 513 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 NF2P35240 595 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 FKBP1BP68106 108 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 ATG9AQ7Z3C6 839 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 VEZTQ9HBM0 779 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 FGFR2P21802 821 aa18.77■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 GRIK5Q16478 980 aa18.77■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.77■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.77■□□□□ 0.6
CTIF-203ENST00000587752 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.77■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 MYO1BO43795 1136 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 SLC5A1P13866 664 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 RASAL3Q86YV0 1011 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 FZD1Q9UP38 647 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 GNAI3P08754 354 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 LPIN2Q92539 896 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 CIAO1O76071 339 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 ATP2B3Q16720 1220 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 CA12O43570 354 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 CRKP46108 304 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 ARMC9Q7Z3E5 817 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 SERPINA10Q9UK55 444 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 SRGAP3O43295 1099 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms