RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.72□□□□□ -0.53
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PTPRM-210ENST00000578916 ZNF333Q96JL9 665 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRM-210ENST00000578916 MPHOSPH8Q99549 860 aa11.72□□□□□ -0.53
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PTPRM-210ENST00000578916 CD209Q9NNX6 404 aa11.72□□□□□ -0.53
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PTPRM-210ENST00000578916 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 TLR2O60603 784 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 GNRH1P01148 92 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 CETPP11597 493 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 CASP7P55210 303 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 PRMT2P55345 433 aa11.63□□□□□ -0.55
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