RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578773.1

GGA3-206, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-206ENST00000578773 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 XDHP47989 1333 aa14.62□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 GPR153Q6NV75 609 aa14.61□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 TRIM47Q96LD4 638 aa14.61□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 RNF208Q9H0X6 261 aa14.61□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.61□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 MED23Q9ULK4 1368 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 OSBPP22059 807 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 CDH23Q9H251 3354 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 SYN1P17600 705 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 ATP2B4P23634 1241 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 GRK4P32298 578 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 CERS5Q8N5B7 392 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 FAM161BQ96MY7 647 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 RPTORQ8N122 1335 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-206ENST00000578773 TLR2O60603 784 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 ARHGEF6Q15052 776 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 SRRDQ9UH36 339 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 CPA4Q9UI42 421 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 BTBD19C9JJ37 291 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 BMP8BP34820 402 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 GTF2IP78347 998 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 VGLL4Q14135 290 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 VEZTQ9HBM0 779 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 F8W031 263 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 PSMC4P43686 418 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 AK9Q5TCS8 1911 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 SGPL1O95470 568 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 RASA3Q14644 834 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 KIF22Q14807 665 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 DLGAP5Q15398 846 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 RAET1EQ8TD07 263 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 CFAP53Q96M91 514 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 GABRQQ9UN88 632 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 NUDCQ9Y266 331 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 MYPNQ86TC9 1320 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 UNCXA6NJT0 531 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 GTF2A2P52657 109 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 PRKCZQ05513 592 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 CFAP100Q494V2 611 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 C17orf99Q6UX52 265 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 TDHQ8IZJ6 230 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.54□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 SPDYE6P0CI01 402 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 PRMT2P55345 433 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 NFE2L2Q16236 605 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 COA1Q9GZY4 146 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 JAG2Q9Y219 1238 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
GGA3-206ENST00000578773 ELNP15502 786 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 TEPSINQ96N21 525 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 DEFB118Q96PH6 123 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 SNAP23O00161 211 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 GNRH1P01148 92 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 PPP2R1AP30153 589 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 POTEB2H3BUK9 544 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 PLA2G5P39877 138 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 PTPRFP10586 1907 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 IRF6O14896 467 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 PDE8AO60658 829 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-206ENST00000578773 INHAP05111 366 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms