RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-209	ENST00000574205	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZBTB22	O15209	634 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	40.7	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HACL1	Q9UJ83	578 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	AACS	Q86V21	672 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SEMA3E	O15041	775 aa		40.68	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GML	Q99445	158 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	40.67	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	JAG2	Q9Y219	1238 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GCC1	Q96CN9	775 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MXD3	Q9BW11	206 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		40.65	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	40.65	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	EPS15	P42566	896 aa		40.64	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		40.64	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KIF3C	O14782	793 aa		40.63	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		40.63	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MICALL2	Q8IY33	904 aa		40.63	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		40.63	■■■■■ 4.1
CTDNEP1-209	ENST00000574205	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	40.62	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	EPHX2	P34913	555 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CERS5	Q8N5B7	392 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RASGRF1	Q13972	1273 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205		H7C1D1	291 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	40.61	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NEFL	P07196	543 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	BCL11A	Q9H165	835 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IGHD	P01880	384 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	USP17L8	P0C7I0	530 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SHTN1	A0MZ66	631 aa		40.57	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MMP14	P50281	582 aa		40.57	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		40.57	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	OGFOD1	Q8N543	542 aa		40.57	■■■■■ 4.09
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SMC5	Q8IY18	1101 aa		40.57	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MCAM	P43121	646 aa		40.55	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		40.55	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SPATA5	Q8NB90	893 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SCARF1	Q14162	830 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205		F8W031	263 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PI16	Q6UXB8	463 aa		40.51	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		40.51	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	40.51	■■■■■ 4.08
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		40.5	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TOMM70	O94826	608 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	EGFR	P00533	1210 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GRIK5	Q16478	980 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	POTEI	P0CG38	1075 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	POTEJ	P0CG39	1038 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LDHD	Q86WU2	507 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MAST3	O60307	1309 aa		40.45	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	40.45	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SNRK	Q9NRH2	765 aa		40.45	■■■■■ 4.07
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PRDX5	P30044	214 aa		40.44	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ABCF2	Q9UG63	623 aa		40.44	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GPATCH3	Q96I76	525 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ATP5J	P18859	108 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZAP70	P43403	619 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		40.41	■■■■■ 4.06

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