RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 G2E3Q7L622 706 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 MAP3K11Q16584 847 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 VEZTQ9HBM0 779 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 OTOFQ9HC10 1997 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 CRHR2Q13324 411 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 CFAP100Q494V2 611 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 ERO1AQ96HE7 468 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 JAG2Q9Y219 1238 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 AOX1Q06278 1338 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 TAF5LO75529 589 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 GJA5P36382 358 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 GCKRQ14397 625 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 MYO1BO43795 1136 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 SPDYE6P0CI01 402 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 CASP7P55210 303 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 BRCA2P51587 3418 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 SLC4A2P04920 1241 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 CSF1RP07333 972 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 CAP1Q01518 475 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 EFCC1Q9HA90 598 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCDC40-211ENST00000574099 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 SP3Q02447 781 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 RASA3Q14644 834 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 ARMC5Q96C12 935 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 PTPN18Q99952 460 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 ELP3Q9H9T3 547 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 FLIIQ13045 1269 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 IL1R1P14778 569 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 OPTNQ96CV9 577 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 UNCXA6NJT0 531 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 PLIN1O60240 522 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 LINS1Q8NG48 757 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 FOXO4P98177 505 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF333Q96JL9 665 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC40-211ENST00000574099 TNFAIP1Q13829 316 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.31■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 CCL15Q16663 113 aa22.31■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.31■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 CACNA1FO60840 1977 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 F6X3S4 739 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 VGLL4Q14135 290 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 WWC1Q8IX03 1113 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 OTUD5Q96G74 571 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 TEPSINQ96N21 525 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms