RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572588.1

MKL2-206, Transcript of MKL/myocardin-like protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene MKL2, Length 7,897 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL2-206	ENST00000572588	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ATRN	O75882	1429 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CSF1R	P07333	972 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CCDC125	Q86Z20	511 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	STAP2	Q9UGK3	403 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SLMAP	Q14BN4	828 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CHADL	Q6NUI6	762 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ST18	O60284	1047 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MYL6B	P14649	208 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ITPK1	Q13572	414 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CBX8	Q9HC52	389 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ST7	Q9NRC1	585 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PDE1A	P54750	535 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	POTEA	Q6S8J7	498 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	JDP2	Q8WYK2	163 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CCT6B	Q92526	530 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PDE8A	O60658	829 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TBC1D8	O95759	1140 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NF2	P35240	595 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ACAP2	Q15057	778 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	INF2	Q27J81	1249 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TMC4	Q7Z404	712 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TOMM22	Q9NS69	142 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NTSR2	O95665	410 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MCM2	P49736	904 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	RABEP1	Q15276	862 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	KIF1A	Q12756	1690 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SSFA2	P28290	1259 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	KAZALD1	Q96I82	304 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	GNPAT	O15228	680 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CNPY4	Q8N129	248 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	AIDA	Q96BJ3	306 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CIAO1	O76071	339 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CCDC181	Q5TID7	509 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MRGBP	Q9NV56	204 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SKAP1	Q86WV1	359 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NLRP3	Q96P20	1036 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NLRP10	Q86W26	655 aa		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms