RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.85■□□□□ 0.93
SPNS1-211ENST00000568829 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.85■□□□□ 0.93
SPNS1-211ENST00000568829 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SPNS1-211ENST00000568829 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SPNS1-211ENST00000568829 TSKSQ9UJT2 592 aa20.84■□□□□ 0.93
SPNS1-211ENST00000568829 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.84■□□□□ 0.93
SPNS1-211ENST00000568829 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.83■□□□□ 0.93
SPNS1-211ENST00000568829 SNAP23O00161 211 aa20.83■□□□□ 0.93
SPNS1-211ENST00000568829 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
SPNS1-211ENST00000568829 ABHD8Q96I13 439 aa20.83■□□□□ 0.93
SPNS1-211ENST00000568829 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 METTL24Q5JXM2 366 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.82■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 F8W031 263 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 TNFAIP1Q13829 316 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 CFAP100Q494V2 611 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 KAZALD1Q96I82 304 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 CSRNP1Q96S65 589 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 ZIC5Q96T25 663 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 UNCXA6NJT0 531 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 TRPA1O75762 1119 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 SPDYE6P0CI01 402 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 SREBF2Q12772 1141 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 CERS5Q8N5B7 392 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 USP44Q9H0E7 712 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 RNF186Q9NXI6 227 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 PDE8BO95263 885 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 GYG1P46976 350 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 VEZTQ9HBM0 779 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 FBXO3Q9UK99 471 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-211ENST00000568829 KIF16BQ96L93 1317 aa20.77■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 JAG2Q9Y219 1238 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 TNNI2P48788 182 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 INHBEP58166 350 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 DGKZQ13574 1117 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 LRRC24Q50LG9 513 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 MOB2Q70IA6 237 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 MAST3O60307 1309 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 SLC5A1P13866 664 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 PRKG1Q13976 671 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 CLRN2A0PK11 232 aa20.73■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 EYA2O00167 538 aa20.73■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 ALDH1A1P00352 501 aa20.73■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 TM4SF4P48230 202 aa20.73■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 MAP3K11Q16584 847 aa20.73■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.73■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 LPIN2Q92539 896 aa20.73■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.73■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.73■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 A0A1B0GUL6 1792 aa20.72■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.72■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.72■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 RASA3Q14644 834 aa20.71■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.71■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 TEKT1Q969V4 418 aa20.71■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 MRIQ9BWK5 157 aa20.71■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.7■□□□□ 0.91
SPNS1-211ENST00000568829 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SPNS1-211ENST00000568829 CIAO1O76071 339 aa20.7■□□□□ 0.9
SPNS1-211ENST00000568829 CRKP46108 304 aa20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 375.3 ms