RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567228.1

E2F4-209, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-209ENST00000567228 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.39■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 A0A1B0GUL6 1792 aa24.38■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 MOB2Q70IA6 237 aa24.37■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.37■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.37■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.36■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 LRRC24Q50LG9 513 aa24.36■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.35■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 CSRNP1Q96S65 589 aa24.35■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.35■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 GYG1P46976 350 aa24.34■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.34■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.34■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.33■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.33■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 JAG2Q9Y219 1238 aa24.33■■□□□ 1.49
E2F4-209ENST00000567228 AOX1Q06278 1338 aa24.33■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.32■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 DLGAP5Q15398 846 aa24.32■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.32■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.31■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 SPDYE6P0CI01 402 aa24.31■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 RNF186Q9NXI6 227 aa24.31■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.31■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 F8W031 263 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 PDE8BO95263 885 aa24.3■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 CFAP100Q494V2 611 aa24.3■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.3■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 ABHD8Q96I13 439 aa24.3■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.3■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 FGFR2P21802 821 aa24.28■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.28■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 GRIK5Q16478 980 aa24.27■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 METTL24Q5JXM2 366 aa24.27■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
E2F4-209ENST00000567228 TRPA1O75762 1119 aa24.26■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 MAP3K11Q16584 847 aa24.26■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.26■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 NF2P35240 595 aa24.25■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.25■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 CLRN2A0PK11 232 aa24.24■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 EYA2O00167 538 aa24.24■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 BCAMP50895 628 aa24.24■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 FZD1Q9UP38 647 aa24.24■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.24■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 TM4SF4P48230 202 aa24.23■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.23■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 KIF16BQ96L93 1317 aa24.23■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.23■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.22■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.22■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.22■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 MYO1BO43795 1136 aa24.21■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 PRKG1Q13976 671 aa24.21■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.21■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.21■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
E2F4-209ENST00000567228 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 RASA3Q14644 834 aa24.2■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 MRIQ9BWK5 157 aa24.2■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 FBXO3Q9UK99 471 aa24.2■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 CRKP46108 304 aa24.19■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.465e-8■■□□□ 11.7
E2F4-209ENST00000567228 VPS37DQ86XT2 251 aa24.19■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 MEIS3Q99687 375 aa24.19■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 CIAO1O76071 339 aa24.18■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.18■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 SPRYD7Q5W111 196 aa24.18■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.18■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 LPIN2Q92539 896 aa24.18■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 TEPSINQ96N21 525 aa24.18■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 VEZTQ9HBM0 779 aa24.18■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 UNCXA6NJT0 531 aa24.17■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
E2F4-209ENST00000567228 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms