RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCN4AP35499 1836 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.52■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.52■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.52■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPR108Q9NPR9 543 aa21.52■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 F8W031 263 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 H7C1D1 291 aa21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRIK5Q16478 980 aa21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCTPP1Q9H773 170 aa21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOMM70O94826 608 aa21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP17L8P0C7I0 530 aa21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 GORABQ5T7V8 394 aa21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAB11FIP3O75154 756 aa21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 AACSQ86V21 672 aa21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RASGRF1Q13972 1273 aa21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PI16Q6UXB8 463 aa21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCARF1Q14162 830 aa21.45■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.45■■□□□ 1.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 AAMPQ13685 434 aa21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGHDP01880 384 aa21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 LDHDQ86WU2 507 aa21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 MCAMP43121 646 aa21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHADLQ6NUI6 762 aa21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 OGFOD1Q8N543 542 aa21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNRKQ9NRH2 765 aa21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SEMA3EO15041 775 aa21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 C1QTNF8P60827 252 aa21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPATA5Q8NB90 893 aa21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRDX5P30044 214 aa21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 DLK2Q6UY11 383 aa21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 AOX1Q06278 1338 aa21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 WNT10BO00744 389 aa21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBTB22O15209 634 aa21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 24.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 CFAP100Q494V2 611 aa21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNTROBQ8N137 903 aa21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCF2Q9UG63 623 aa21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZAP70P43403 619 aa21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 FSTL1Q12841 308 aa21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 DLGAP5Q15398 846 aa21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms