RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	ADCY9	O60503	1353 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	NEFL	P07196	543 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	TCIRG1	Q13488	830 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	PROSER3	Q2NL68	480 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	PARP10	Q53GL7	1025 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	LINS1	Q8NG48	757 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	LAMB2	P55268	1798 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	MYH3	P11055	1940 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	CAMTA2	O94983	1202 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	FOXK2	Q01167	660 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	UTY	O14607	1347 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	CASZ1	Q86V15	1759 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	GNAI3	P08754	354 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	MAP2K5	Q13163	448 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	BEND3	Q5T5X7	828 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	G2E3	Q7L622	706 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	NYX	Q9GZU5	481 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	PPFIA3	O75145	1194 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	ANXA1	P04083	346 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	IRS1	P35568	1242 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF827	Q17R98	1081 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	GRM8	O00222	908 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	GYS1	P13807	737 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	KCNQ4	P56696	695 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	KRT76	Q01546	638 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	GCKR	Q14397	625 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ARX	Q96QS3	562 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	MYD88	Q99836	296 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965		F6X3S4	739 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ADAM23	O75077	832 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	IGKV5-2	P06315	115 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	NLRP10	Q86W26	655 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965		H7C1W4	665 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	SOCS7	O14512	581 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	IRF6	O14896	467 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PLIN1	O60240	522 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	MAN1A2	O60476	641 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	GNAI2	P04899	355 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	RLBP1	P12271	317 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	TM4SF1	P30408	202 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	MTX1	Q13505	466 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	HLF	Q16534	295 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		7.19	□□□□□ -1.26

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