RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 ATAD2Q6PL18 1390 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 SLURP2P0DP57 97 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 SEC13P55735 322 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 EFHC2Q5JST6 749 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 FOXR1Q6PIV2 292 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 PGBD3Q8N328 593 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 ABTB2Q8N961 1025 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 TRERF1Q96PN7 1200 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 TEAD4Q15561 434 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 TBCELQ5QJ74 424 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 FAM182BQ5T319 152 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 NME9Q86XW9 330 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 MBIPQ9NS73 344 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 BTG4Q9NY30 223 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 NHSQ6T4R5 1651 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 EML1O00423 815 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 RXRBP28702 533 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 TXLNAP40222 546 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 DPYDQ12882 1025 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ANKMY2Q8IV38 441 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 AIDAQ96BJ3 306 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 VRTNQ9H8Y1 702 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 SSH2Q76I76 1423 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 FAM83GA6ND36 823 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 C21orf2O43822 256 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 NOS2P35228 1153 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 PKD1L3Q7Z443 1732 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 NLRP8Q86W28 1048 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 TESK2Q96S53 571 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 USP19O94966 1318 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa5.95□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1W2PNR3 127 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 SERTM1A2A2V5 107 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 FAM181BA6NEQ2 426 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 MX2P20592 715 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 FBLN1P23142 703 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 CFHR5Q9BXR6 569 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 PHF24Q9UPV7 400 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.94□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 TAF1LQ8IZX4 1826 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 RFX1P22670 979 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 TMF1P82094 1093 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 UNC5CLQ8IV45 518 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 SVOPQ8N4V2 548 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 WHAMMQ8TF30 809 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ZIC5Q96T25 663 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa5.93□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 C5P01031 1676 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 BNIP3LO60238 219 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 FAM157BP0CG42 384 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 EVA1CP58658 441 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 NLRP13Q86W25 1043 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms