RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 SAGE1Q9NXZ1 904 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 RIC1Q4ADV7 1423 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 FLIIQ13045 1269 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 SLC10A5Q5PT55 438 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 DLK2Q6UY11 383 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 CDC37L1Q7L3B6 337 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 FAM89AQ96GI7 184 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 NLRP3Q96P20 1036 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 RNF186Q9NXI6 227 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 PGAP2Q9UHJ9 254 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 RGMBQ6NW40 437 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 NYAP1Q6ZVC0 841 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 USP48Q86UV5 1035 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 ZNRF3Q9ULT6 936 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 SHTN1A0MZ66 631 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 F6X3S4 739 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 RAD17O75943 681 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 GCC1Q96CN9 775 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 CDHR2Q9BYE9 1310 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 IGKV5-2P06315 115 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 CCDC191Q8NCU4 936 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 KCNC4Q03721 635 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 DNAAF4Q8WXU2 420 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 CCDC102AQ96A19 550 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 CRAMP1Q96RY5 1269 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 NEURL1BA8MQ27 555 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 TNIP1Q15025 636 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 C2orf69Q8N8R5 385 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 ADAM33Q9BZ11 813 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 RABGEF1Q9UJ41 708 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 ADM5C9JUS6 153 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 H7C1D1 291 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 SLC4A10Q6U841 1118 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 KRT26Q7Z3Y9 468 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 SUPT20HQ8NEM7 779 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 CSRNP1Q96S65 589 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 VPS33BQ9H267 617 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 SLC10A3P09131 477 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 GCKRQ14397 625 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 TRAF7Q6Q0C0 670 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 SAMD7Q7Z3H4 446 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 LINS1Q8NG48 757 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 HDAC9Q9UKV0 1011 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-217ENST00000550044 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 ABCC4O15439 1325 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 H7C1W4 665 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 EVI5O60447 810 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 BEND3Q5T5X7 828 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 SMC4Q9NTJ3 1288 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 YDJCA8MPS7 323 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 PDE8AO60658 829 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 EGFRP00533 1210 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 BCAMP50895 628 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 ALDH1L2Q3SY69 923 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 LAPTM4BQ86VI4 370 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-217ENST00000550044 MPNDQ8N594 471 aa12.19□□□□□ -0.46
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