RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	MAST3	O60307	1309 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541		H0YIN7	160 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC27A2	O14975	620 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	PDE6A	P16499	860 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC4A3	P48751	1232 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	PI16	Q6UXB8	463 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	RASEF	Q8IZ41	740 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	GGA1	Q9UJY5	639 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	TAF1	P21675	1872 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	GPSM2	P81274	684 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	VPS53	Q5VIR6	699 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541		M0R2C6	588 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	GPAA1	O43292	621 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	GNAT2	P19087	354 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ALX1	Q15699	326 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	RUFY3	Q7L099	469 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	CNKSR1	Q969H4	720 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	CHGB	P05060	677 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	IL1R1	P14778	569 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	MSL1	Q68DK7	614 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	MPND	Q8N594	471 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	TTC14	Q96N46	770 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ZMYM6	O95789	1325 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	DOCK2	Q92608	1830 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	UFL1	O94874	794 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ANKRD1	Q15327	319 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	AIDA	Q96BJ3	306 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	CD209	Q9NNX6	404 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-208	ENST00000547541	MYH7	P12883	1935 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	FGA	P02671	866 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CYP21A2	P08686	494 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	KLRK1	P26718	216 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	NEK1	Q96PY6	1258 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	EYA3	Q99504	573 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	COA1	Q9GZY4	146 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	RAI14	Q9P0K7	980 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	ABCF2	Q9UG63	623 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	POLL	Q9UGP5	575 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	C6orf229	H3BNL8	230 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF213	O14771	459 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CYP7A1	P22680	504 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	RPS6KB1	P23443	525 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	GSTO1	P78417	241 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CUL4A	Q13619	759 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CERS3	Q8IU89	383 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	FBXL16	Q8N461	479 aa		12.01	□□□□□ -0.49

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