RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542964.5

MEIS1-215, Transcript of Meis homeobox 1, human

TSL 5

Gene MEIS1, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEIS1-215	ENST00000542964	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	IL1R1	P14778	569 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	GYG1	P46976	350 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	SLC10A3	P09131	477 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	PDE8B	O95263	885 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	SLC5A1	P13866	664 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	PRKG1	Q13976	671 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MEIS1-215	ENST00000542964	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.21	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	EYA2	O00167	538 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	ZIC5	Q96T25	663 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	SIL1	Q9H173	461 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	MAST3	O60307	1309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	GNAI3	P08754	354 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	TRPA1	O75762	1119 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	CRK	P46108	304 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	TNNI2	P48788	182 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	BCAM	P50895	628 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	LPIN2	Q92539	896 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	CIAO1	O76071	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	MIER1	Q8N108	512 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEIS1-215	ENST00000542964	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.17	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms