RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-215ENST00000539613 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 CASP7P55210 303 aa26.44■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.44■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 CERS5Q8N5B7 392 aa26.44■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 LINS1Q8NG48 757 aa26.44■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 JAG2Q9Y219 1238 aa26.44■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.44■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 CSF1RP07333 972 aa26.43■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 WWC1Q8IX03 1113 aa26.43■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.43■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.43■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 TRIM17Q9Y577 477 aa26.43■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.42■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 CFAP100Q494V2 611 aa26.42■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 WNK4Q96J92 1243 aa26.42■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.42■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC27Q2M243 656 aa26.41■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 IFNL1Q8IU54 200 aa26.41■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.4■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.39■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.39■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 SPDYE6P0CI01 402 aa26.39■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.39■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 PLIN1O60240 522 aa26.38■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 INHBEP58166 350 aa26.38■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.38■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 IL16Q14005 1332 aa26.38■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.38■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 MAP3K11Q16584 847 aa26.37■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC184Q52MB2 194 aa26.37■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 F6X3S4 739 aa26.36■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.36■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.36■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 HTTP42858 3142 aa26.36■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 IL1R1P14778 569 aa26.35■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 FOXO4P98177 505 aa26.35■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.35■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.35■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 ERO1AQ96HE7 468 aa26.35■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 AOX1Q06278 1338 aa26.35■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.34■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 CRHR2Q13324 411 aa26.33■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 RASA3Q14644 834 aa26.33■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.33■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 CD99L2Q8TCZ2 262 aa26.33■■□□□ 1.81
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.32■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 GJA5P36382 358 aa26.31■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 TNFAIP1Q13829 316 aa26.31■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 ELP3Q9H9T3 547 aa26.31■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 CENPFP49454 3210 aa26.31■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 POTEFA5A3E0 1075 aa26.3■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.3■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 UNCXA6NJT0 531 aa26.29■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 VAMP4O75379 141 aa26.29■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.29■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 BEND3Q5T5X7 828 aa26.29■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 GCC1Q96CN9 775 aa26.29■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 OPTNQ96CV9 577 aa26.29■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 GRM8O00222 908 aa26.28■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 EFCC1Q9HA90 598 aa26.28■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.28■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 GYG1P46976 350 aa26.27■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.27■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.26■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 SP3Q02447 781 aa26.26■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.26■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 MRS2Q9HD23 443 aa26.26■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.25■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.24■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 PTPN18Q99952 460 aa26.24■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.24■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.24■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 TNNI2P48788 182 aa26.23■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 CSADQ9Y600 493 aa26.23■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 CRKP46108 304 aa26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms