RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, human

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRJ-206	ENST00000534219	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	DLGAP5	Q15398	846 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	TSKS	Q9UJT2	592 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZIC5	Q96T25	663 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	FKBP1B	P68106	108 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	VPS37D	Q86XT2	251 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219		A0A1B0GUL6	1792 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	CA12	O43570	354 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	NF2	P35240	595 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	MOB2	Q70IA6	237 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	MIER1	Q8N108	512 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	PDE8B	O95263	885 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	31.23	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	CFAP100	Q494V2	611 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYO1B	O43795	1136 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC10A3	P09131	477 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.2	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	CLRN2	A0PK11	232 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	EYA2	O00167	538 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	SPDYE6	P0CI01	402 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRKG1	Q13976	671 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	VEZT	Q9HBM0	779 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.16	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	SIL1	Q9H173	461 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	BCAM	P50895	628 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	CSRNP1	Q96S65	589 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	MEIS3	Q99687	375 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PTPRJ-206	ENST00000534219	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC5A1	P13866	664 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	FGFR2	P21802	821 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	BCAR3	O75815	825 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	AOX1	Q06278	1338 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	LPIN2	Q92539	896 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRPA1	O75762	1119 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	RNF186	Q9NXI6	227 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	FBXO3	Q9UK99	471 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	CIAO1	O76071	339 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	GNAI3	P08754	354 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	CRK	P46108	304 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	FZD1	Q9UP38	647 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	GRIK5	Q16478	980 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRIM27	P14373	513 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PTPRJ-206	ENST00000534219	RASA3	Q14644	834 aa		31.07	■■■□□ 2.56

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