RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533872.5

RPS2-215, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-215	ENST00000533872	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	30.18	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	30.18	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	30.18	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	GML	Q99445	158 aa		30.18	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	30.18	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	SEMA3E	O15041	775 aa		30.17	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	GORAB	Q5T7V8	394 aa		30.17	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		30.17	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	30.17	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	AACS	Q86V21	672 aa		30.16	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	30.16	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	30.16	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	GCC1	Q96CN9	775 aa		30.15	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	MXD3	Q9BW11	206 aa		30.15	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	30.15	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	KIF3C	O14782	793 aa		30.14	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	EPS15	P42566	896 aa		30.14	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	30.14	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	30.14	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	30.14	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		30.14	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	JAG2	Q9Y219	1238 aa		30.14	■■■□□ 2.42
RPS2-215	ENST00000533872	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	30.13	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	EPHX2	P34913	555 aa		30.13	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	30.13	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		30.13	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	MICALL2	Q8IY33	904 aa		30.13	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	CERS5	Q8N5B7	392 aa		30.13	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		30.13	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	30.13	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	RASGRF1	Q13972	1273 aa		30.12	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		30.12	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		30.11	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		30.11	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	30.11	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	30.11	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872		H7C1D1	291 aa		30.1	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	30.1	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	USP17L8	P0C7I0	530 aa		30.1	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	MMP14	P50281	582 aa		30.1	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	30.1	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		30.1	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	SHTN1	A0MZ66	631 aa		30.09	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	30.09	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	IGHD	P01880	384 aa		30.09	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	30.09	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	SMC5	Q8IY18	1101 aa		30.09	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		30.09	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		30.08	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		30.08	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	NEFL	P07196	543 aa		30.08	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		30.08	■■■□□ 2.41
RPS2-215	ENST00000533872	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	30.07	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	OGFOD1	Q8N543	542 aa		30.07	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		30.07	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		30.07	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	MCAM	P43121	646 aa		30.06	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	30.06	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		30.06	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	SCARF1	Q14162	830 aa		30.05	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	SPATA5	Q8NB90	893 aa		30.05	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	BCL11A	Q9H165	835 aa		30.05	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	30.04	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	TOMM70	O94826	608 aa		30.03	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	30.03	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	PI16	Q6UXB8	463 aa		30.03	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		30.03	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		30.03	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		30.03	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872		F8W031	263 aa	Predicted RBP	30.02	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	GRIK5	Q16478	980 aa		30.02	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		30.02	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		30.02	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	30.02	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	30.02	■■■□□ 2.4
RPS2-215	ENST00000533872	EGFR	P00533	1210 aa		30.01	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	30.01	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	LDHD	Q86WU2	507 aa		30.01	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	30.01	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	MAST3	O60307	1309 aa		30	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	POTEI	P0CG38	1075 aa		30	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	POTEJ	P0CG39	1038 aa		30	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	30	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	30	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	PRDX5	P30044	214 aa		29.98	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	29.98	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	29.98	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		29.98	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	SNRK	Q9NRH2	765 aa		29.98	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		29.98	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	ATP5J	P18859	108 aa		29.97	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	GPATCH3	Q96I76	525 aa		29.97	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	ABCF2	Q9UG63	623 aa		29.97	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		29.96	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	ZAP70	P43403	619 aa		29.96	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
RPS2-215	ENST00000533872	MRI	Q9BWK5	157 aa		29.96	■■■□□ 2.39

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms