RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531857.1

PKP3-208, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 4

Gene PKP3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-208ENST00000531857 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 IL16Q14005 1332 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 FKTNO75072 461 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 FOXO4P98177 505 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 AOX1Q06278 1338 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 F8W031 263 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 OTOFQ9HC10 1997 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 VAMP4O75379 141 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 JAG2Q9Y219 1238 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 CLRN2A0PK11 232 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 F6X3S4 739 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 IL1R1P14778 569 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 MAP3K11Q16584 847 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 CFAP100Q494V2 611 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 IFNL1Q8IU54 200 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 SPDYE6P0CI01 402 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 BEND3Q5T5X7 828 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 WNK4Q96J92 1243 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 ALDH1A1P00352 501 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 PLIN1O60240 522 aa22.02■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 INHBEP58166 350 aa22.02■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 VEZTQ9HBM0 779 aa22.02■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 HTTP42858 3142 aa22.02■■□□□ 1.12
PKP3-208ENST00000531857 MYO1BO43795 1136 aa22.01■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 GJA5P36382 358 aa22■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 TRIM17Q9Y577 477 aa22■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 RASA3Q14644 834 aa21.99■■□□□ 1.11
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PKP3-208ENST00000531857 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.99■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 WDR63Q8IWG1 891 aa21.98■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.98■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 UNCXA6NJT0 531 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 GRM8O00222 908 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 CRHR2Q13324 411 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 PTPN18Q99952 460 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 CENPFP49454 3210 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 GYG1P46976 350 aa21.96■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.96■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PKP3-208ENST00000531857 CAP1Q01518 475 aa21.95■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.95■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.95■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.95■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.95■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 MRS2Q9HD23 443 aa21.95■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 POTEFA5A3E0 1075 aa21.94■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 TEPSINQ96N21 525 aa21.94■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 ELP3Q9H9T3 547 aa21.94■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 UBE4AQ14139 1066 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 OPTNQ96CV9 577 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 ERO1AQ96HE7 468 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 KAZALD1Q96I82 304 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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