RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	TNIP1	Q15025	636 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	GRIK5	Q16478	980 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	GPC2	Q8N158	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	MCAM	P43121	646 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	SCNN1D	P51172	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	POTEC	B2RU33	542 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	EPS15	P42566	896 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	SCN4A	P35499	1836 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	ZAP70	P43403	619 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	GML	Q99445	158 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	SEMA3E	O15041	775 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	EGFR	P00533	1210 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	PRDX5	P30044	214 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	NUCB1	Q02818	461 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	EPHX2	P34913	555 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	MX1	P20591	662 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	PDE4A	P27815	886 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM25-208	ENST00000530978	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM25-208	ENST00000530978		H7C1D1	291 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM25-208	ENST00000530978	GOLIM4	O00461	696 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM25-208	ENST00000530978	KIF3C	O14782	793 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM25-208	ENST00000530978	ATP5J	P18859	108 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM25-208	ENST00000530978	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM25-208	ENST00000530978	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM25-208	ENST00000530978	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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