RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 ABCB6Q9NP58 842 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 FSCN2O14926 492 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 RAC1P63000 192 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 A0A096LPE4 126 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 A0A1W2PPZ6 126 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 WISP1O95388 367 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 ITPKAP23677 461 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 ADGRE1Q14246 886 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 MBTPS1Q14703 1052 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 H3BRJ5 948 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 DLGAP3O95886 979 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 MAPK8P45983 427 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 FAAP100Q0VG06 881 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 COL19A1Q14993 1142 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 BCO2Q9BYV7 579 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 EHD4Q9H223 541 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-209ENST00000522928 ALX3O95076 343 aa6.89□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 NOS3P29474 1203 aa6.89□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 PIP4K2BP78356 416 aa6.89□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.89□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.89□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.89□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF576Q9H609 170 aa6.89□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC27Q2M243 656 aa6.88□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 Q6ZS46 218 aa6.88□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.88□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 WNT8BQ93098 351 aa6.88□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.88□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 C9orf172C9J069 976 aa6.87□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 F8W735 103 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 PCDH1Q08174 1060 aa6.87□□□□□ -1.31
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CLVS1-209ENST00000522928 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.87□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 FBF1Q8TES7 1133 aa6.87□□□□□ -1.31
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CLVS1-209ENST00000522928 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.87□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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CLVS1-209ENST00000522928 B3GALT4O96024 378 aa6.86□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 CTSBP07858 339 aa6.86□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.86□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.86□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa6.86□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 ECEL1O95672 775 aa6.85□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 APBA3O96018 575 aa6.85□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 ITGB7P26010 798 aa6.85□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.85□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLVS1-209ENST00000522928 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.85□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.85□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.85□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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CLVS1-209ENST00000522928 NLRP12P59046 1061 aa6.84□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 NACC1Q96RE7 527 aa6.84□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.84□□□□□ -1.31
CLVS1-209ENST00000522928 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.84□□□□□ -1.31
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