RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522721.1

SORBS3-215, Transcript of sorbin and SH3 domain containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene SORBS3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3-215ENST00000522721 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
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SORBS3-215ENST00000522721 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.09■■■□□ 2.25
SORBS3-215ENST00000522721 CDCA5Q96FF9 252 aa29.09■■■□□ 2.25
SORBS3-215ENST00000522721 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.09■■■□□ 2.25
SORBS3-215ENST00000522721 ECE1P42892 770 aa29.08■■■□□ 2.25
SORBS3-215ENST00000522721 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
SORBS3-215ENST00000522721 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
SORBS3-215ENST00000522721 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.08■■■□□ 2.25
SORBS3-215ENST00000522721 JAG2Q9Y219 1238 aa29.08■■■□□ 2.25
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SORBS3-215ENST00000522721 FBXO3Q9UK99 471 aa29.07■■■□□ 2.24
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SORBS3-215ENST00000522721 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
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SORBS3-215ENST00000522721 C2orf69Q8N8R5 385 aa29.03■■■□□ 2.24
SORBS3-215ENST00000522721 COPRSQ9NQ92 184 aa29.03■■■□□ 2.24
SORBS3-215ENST00000522721 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa29.03■■■□□ 2.24
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SORBS3-215ENST00000522721 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SORBS3-215ENST00000522721 SIL1Q9H173 461 aa29.02■■■□□ 2.24
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SORBS3-215ENST00000522721 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.01■■■□□ 2.23
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SORBS3-215ENST00000522721 MAP2K2P36507 400 aa29■■■□□ 2.23
SORBS3-215ENST00000522721 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
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SORBS3-215ENST00000522721 CFAP100Q494V2 611 aa29■■■□□ 2.23
SORBS3-215ENST00000522721 VPS37DQ86XT2 251 aa29■■■□□ 2.23
SORBS3-215ENST00000522721 LPIN2Q92539 896 aa29■■■□□ 2.23
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SORBS3-215ENST00000522721 SLC5A1P13866 664 aa28.97■■■□□ 2.23
SORBS3-215ENST00000522721 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
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SORBS3-215ENST00000522721 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 RLBP1P12271 317 aa28.94■■■□□ 2.22
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SORBS3-215ENST00000522721 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
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SORBS3-215ENST00000522721 ZIC5Q96T25 663 aa28.94■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.94■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 NOGQ13253 232 aa28.93■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.92■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
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SORBS3-215ENST00000522721 MOB2Q70IA6 237 aa28.92■■■□□ 2.22
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SORBS3-215ENST00000522721 CLRN2A0PK11 232 aa28.91■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 SLC10A3P09131 477 aa28.91■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 CCDC102AQ96A19 550 aa28.91■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.91■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 PRDM10Q9NQV6 1147 aa28.91■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.9■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 ZBTB22O15209 634 aa28.9■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 MYO1BO43795 1136 aa28.89■■■□□ 2.22
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SORBS3-215ENST00000522721 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.228e-6■■■■□ 20.7
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SORBS3-215ENST00000522721 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.89■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa28.89■■■□□ 2.22
SORBS3-215ENST00000522721 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SORBS3-215ENST00000522721 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.88■■■□□ 2.21
SORBS3-215ENST00000522721 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.88■■■□□ 2.21
SORBS3-215ENST00000522721 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SORBS3-215ENST00000522721 SSC5DA1L4H1 1573 aa28.88■■■□□ 2.21
SORBS3-215ENST00000522721 UBE2Q2LH0YL09 131 aa28.87■■■□□ 2.21
SORBS3-215ENST00000522721 ADORA1P30542 326 aa28.87■■■□□ 2.21
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