RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522033.1

GLI4-208, Transcript of GLI family zinc finger 4, human

TSL 2

Gene GLI4, Length 615 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLI4-208	ENST00000522033	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	TNN	Q9UQP3	1299 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	ADM5	C9JUS6	153 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	CERS5	Q8N5B7	392 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	LPIN2	Q92539	896 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	SIL1	Q9H173	461 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	COPRS	Q9NQ92	184 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	SLC5A1	P13866	664 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	FGFR2	P21802	821 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	MTX1	Q13505	466 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	PCNT	O95613	3336 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	SRGAP3	O43295	1099 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	DLGAP5	Q15398	846 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GLI4-208	ENST00000522033	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	CAPNS2	Q96L46	248 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	JAG2	Q9Y219	1238 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	BCAM	P50895	628 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	DLK2	Q6UY11	383 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	CDCA5	Q96FF9	252 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033		F8W031	263 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	MS4A1	P11836	297 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	MYO1B	O43795	1136 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	ATP2B3	Q16720	1220 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	HUNK	P57058	714 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	CFAP100	Q494V2	611 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
GLI4-208	ENST00000522033	MAP2K2	P36507	400 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	28.57	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	FKBP1B	P68106	108 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	GRM1	Q13255	1194 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	AIDA	Q96BJ3	306 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	SPDYE6	P0CI01	402 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	NF2	P35240	595 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	RLBP1	P12271	317 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	WBP1L	Q9NX94	342 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	28.53	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	RGMB	Q6NW40	437 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	CCDC102A	Q96A19	550 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		28.52	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	MRI	Q9BWK5	157 aa		28.52	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		28.52	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		28.52	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
GLI4-208	ENST00000522033	MAST3	O60307	1309 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	SEMA3E	O15041	775 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	ATP8B2	P98198	1209 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	NOG	Q13253	232 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	ZBTB22	O15209	634 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	CRK	P46108	304 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	TFCP2	Q12800	502 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	AOC2	O75106	756 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	TIMM10	P62072	90 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	TNFAIP1	Q13829	316 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	POLA2	Q14181	598 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	PANK1	Q8TE04	598 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GLI4-208	ENST00000522033	SSH3	Q8TE77	659 aa		28.48	■■■□□ 2.15

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