RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.81□□□□□ -0.52
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TRPS1-211ENST00000520276 SYT1P21579 422 aa11.81□□□□□ -0.52
TRPS1-211ENST00000520276 TYRO3Q06418 890 aa11.81□□□□□ -0.52
TRPS1-211ENST00000520276 ZSCAN26Q16670 478 aa11.81□□□□□ -0.52
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TRPS1-211ENST00000520276 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.79□□□□□ -0.52
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF827Q17R98 1081 aa11.78□□□□□ -0.52
TRPS1-211ENST00000520276 DRC1Q96MC2 740 aa11.78□□□□□ -0.52
TRPS1-211ENST00000520276 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.78□□□□□ -0.52
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.78□□□□□ -0.52
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.78□□□□□ -0.52
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TRPS1-211ENST00000520276 SKILP12757 684 aa11.77□□□□□ -0.52
TRPS1-211ENST00000520276 SRLQ86TD4 932 aa11.77□□□□□ -0.52
TRPS1-211ENST00000520276 NCAPGQ9BPX3 1015 aa11.77□□□□□ -0.52
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TRPS1-211ENST00000520276 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.53
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TRPS1-211ENST00000520276 IL25Q9H293 177 aa11.77□□□□□ -0.53
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TRPS1-211ENST00000520276 NFIXQ14938 502 aa11.77□□□□□ -0.53
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TRPS1-211ENST00000520276 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
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TRPS1-211ENST00000520276 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.76□□□□□ -0.53
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TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.76□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.76□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 FBXW7Q969H0 707 aa11.76□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.76□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 ATP10DQ9P241 1426 aa11.76□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.76□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.76□□□□□ -0.53
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TRPS1-211ENST00000520276 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa11.75□□□□□ -0.53
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TRPS1-211ENST00000520276 C6orf229H3BNL8 230 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 CLGNO14967 610 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 CAMTA2O94983 1202 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 GYS1P13807 737 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 CCZ1BP86790 482 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 LMBR1LQ6UX01 489 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 TTC6Q86TZ1 520 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-211ENST00000520276 CNKSR1Q969H4 720 aa11.74□□□□□ -0.53
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