RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515332.5

SGMS2-209, Transcript of sphingomyelin synthase 2, human

TSL 3

Gene SGMS2, Length 498 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGMS2-209	ENST00000515332	CD209	Q9NNX6	404 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	KCNJ4	P48050	445 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332		F8W031	263 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	ITGA6	P23229	1130 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	SP3	Q02447	781 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	PTPN18	Q99952	460 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	UNCX	A6NJT0	531 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332		H7C1W4	665 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	VEZT	Q9HBM0	779 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	SNAP23	O00161	211 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	CHRND	Q07001	517 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	CFAP100	Q494V2	611 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	TSPYL6	Q8N831	410 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	AOX1	Q06278	1338 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	MYO1B	O43795	1136 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
SGMS2-209	ENST00000515332	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	APAF1	O14727	1248 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	SPDYE6	P0CI01	402 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF333	Q96JL9	665 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	ELP3	Q9H9T3	547 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	RASA3	Q14644	834 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	JAG2	Q9Y219	1238 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	TAF5L	O75529	589 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	OPTN	Q96CV9	577 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	CSF1R	P07333	972 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	G2E3	Q7L622	706 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SGMS2-209	ENST00000515332	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	31.13	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	CASP7	P55210	303 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	GCKR	Q14397	625 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	STK31	Q9BXU1	1019 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	OTOF	Q9HC10	1997 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	IL1R1	P14778	569 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	NBPF11	Q86T75	865 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	ARHGEF6	Q15052	776 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SGMS2-209	ENST00000515332	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332		H0YGN5	161 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	CCL15	Q16663	113 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332		A0A1B0GUL6	1792 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	TNFAIP1	Q13829	316 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	GTF2A2	P52657	109 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	VGLL4	Q14135	290 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	TEPSIN	Q96N21	525 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	OTUD5	Q96G74	571 aa		31.02	■■■□□ 2.56
SGMS2-209	ENST00000515332	PLIN1	O60240	522 aa		31.01	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	MAP3K9	P80192	1104 aa		31.01	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		31.01	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		31.01	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	SZT2	Q5T011	3432 aa		31.01	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	CEP290	O15078	2479 aa		31	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		31	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	FOXO4	P98177	505 aa		31	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	FLII	Q13045	1269 aa		31	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	LINS1	Q8NG48	757 aa		31	■■■□□ 2.55
SGMS2-209	ENST00000515332	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31	■■■□□ 2.55

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