RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 SNAP23O00161 211 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 KCNJ4P48050 445 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 WDR63Q8IWG1 891 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 OTOFQ9HC10 1997 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 FOXO4P98177 505 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 MAP3K11Q16584 847 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 CD209Q9NNX6 404 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 IFNL1Q8IU54 200 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 AOX1Q06278 1338 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 F6X3S4 739 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 TAF5LO75529 589 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 BEND3Q5T5X7 828 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 ALDH1A1P00352 501 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 WNK4Q96J92 1243 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 DLGAP5Q15398 846 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 POTEFA5A3E0 1075 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 INHBEP58166 350 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 TRIM17Q9Y577 477 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 CENPFP49454 3210 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 GJA5P36382 358 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGA3-215ENST00000515147 CLRN2A0PK11 232 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 ANP32CO43423 234 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 IL1R1P14778 569 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 CAP1Q01518 475 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 F8W031 263 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 SPDYE6P0CI01 402 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 CFAP100Q494V2 611 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 GRM8O00222 908 aa22.87■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.87■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 CRHR2Q13324 411 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 PTPN18Q99952 460 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 JAG2Q9Y219 1238 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 UNCXA6NJT0 531 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 PLIN1O60240 522 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 VEZTQ9HBM0 779 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 BRCA2P51587 3418 aa22.83■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 RASA3Q14644 834 aa22.83■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 ERO1AQ96HE7 468 aa22.83■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.83■■□□□ 1.25
ITGA3-215ENST00000515147 MYO1BO43795 1136 aa22.82■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 ALDH1L1O75891 902 aa22.82■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.82■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 ARMC5Q96C12 935 aa22.82■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 GCC1Q96CN9 775 aa22.82■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.81■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.81■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.81■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.81■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.8■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.8■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.8■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 UBE4AQ14139 1066 aa22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 KAZALD1Q96I82 304 aa22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 SUCLG2Q96I99 432 aa22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 TEPSINQ96N21 525 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms