RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 UBE4AQ14139 1066 aa28.54■■■□□ 2.16
ZBED3-203ENST00000511587 USP44Q9H0E7 712 aa28.54■■■□□ 2.16
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ZBED3-203ENST00000511587 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.52■■■□□ 2.16
ZBED3-203ENST00000511587 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.52■■■□□ 2.16
ZBED3-203ENST00000511587 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.51■■■□□ 2.15
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ZBED3-203ENST00000511587 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.51■■■□□ 2.15
ZBED3-203ENST00000511587 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.5■■■□□ 2.15
ZBED3-203ENST00000511587 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
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ZBED3-203ENST00000511587 LRRC24Q50LG9 513 aa28.48■■■□□ 2.15
ZBED3-203ENST00000511587 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.48■■■□□ 2.15
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ZBED3-203ENST00000511587 CFAP100Q494V2 611 aa28.44■■■□□ 2.14
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ZBED3-203ENST00000511587 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
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ZBED3-203ENST00000511587 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.42■■■□□ 2.14
ZBED3-203ENST00000511587 ABHD8Q96I13 439 aa28.42■■■□□ 2.14
ZBED3-203ENST00000511587 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
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ZBED3-203ENST00000511587 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.41■■■□□ 2.14
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ZBED3-203ENST00000511587 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
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ZBED3-203ENST00000511587 VPS37DQ86XT2 251 aa28.35■■■□□ 2.13
ZBED3-203ENST00000511587 FZD1Q9UP38 647 aa28.35■■■□□ 2.13
ZBED3-203ENST00000511587 BCAMP50895 628 aa28.34■■■□□ 2.13
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ZBED3-203ENST00000511587 TM4SF4P48230 202 aa28.3■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
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ZBED3-203ENST00000511587 MEIS3Q99687 375 aa28.3■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.3■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.29■■■□□ 2.12
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