RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 GGA3Q9NZ52 723 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP2B3Q16720 1220 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 JAG2Q9Y219 1238 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 F8W031 263 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 FGFR2P21802 821 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 BCAMP50895 628 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 DLGAP5Q15398 846 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 RLBP1P12271 317 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 PANK1Q8TE04 598 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 CST9Q5W186 159 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 WNT10BO00744 389 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO1BO43795 1136 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP8B2P98198 1209 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 CERS5Q8N5B7 392 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 CNTNAP1P78357 1384 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 JMYQ8N9B5 988 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 TRPM7Q96QT4 1865 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 RASSF10A6NK89 507 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 ADM5C9JUS6 153 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 ECE1P42892 770 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-210ENST00000505941 TFCP2Q12800 502 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP100Q494V2 611 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 VEGFBP49765 207 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 TIMM10P62072 90 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 GORABQ5T7V8 394 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 SSH3Q8TE77 659 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 CDCA5Q96FF9 252 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 SEMA3EO15041 775 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 NF2P35240 595 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 POLA2Q14181 598 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 COG6Q9Y2V7 657 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1B0GUL7 405 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 GRM1Q13255 1194 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 PDE3AQ14432 1141 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 DLK2Q6UY11 383 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 HHIPL1Q96JK4 782 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 MAST3O60307 1309 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 SPDYE6P0CI01 402 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 HUNKP57058 714 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-210ENST00000505941 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC102BQ68D86 513 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 XAGE2Q96GT9 111 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 CAPNS2Q96L46 248 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 CRKP46108 304 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 TEKT1Q969V4 418 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 VEZTQ9HBM0 779 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 ADORA1P30542 326 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 PHKA1P46020 1223 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 FKBP1BP68106 108 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP85Q6P2H3 762 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 HMMRO75330 724 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms