RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
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SH3BP2-208ENST00000504294 TNNI3KQ59H18 835 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 POTECB2RU33 542 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 BCAMP50895 628 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 TIMM10P62072 90 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 MICALL2Q8IY33 904 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 XAGE2Q96GT9 111 aa17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP2-208ENST00000504294 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP2-208ENST00000504294 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC102BQ68D86 513 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 SIRT2Q8IXJ6 389 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 RHPN1Q8TCX5 695 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNQ5Q9NR82 932 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC11AQ9Y240 323 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GUL6 1792 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 MFSD14BQ5SR56 506 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 CHADLQ6NUI6 762 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 GMLQ99445 158 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRCC1Q9C099 1032 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 DCTPP1Q9H773 170 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 GCC1Q96CN9 775 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 MRIQ9BWK5 157 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 TTC39AQ5SRH9 613 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 SLF2Q8IX21 1173 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 MYOZ2Q9NPC6 264 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 SALL1Q9NSC2 1324 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 MYO1BO43795 1136 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 AACSQ86V21 672 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 PHKA1P46020 1223 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 C1QTNF8P60827 252 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 DLGAP5Q15398 846 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA0825Q8IV33 1275 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 MTMR14Q8NCE2 650 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 GPATCH3Q96I76 525 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 PGAP2Q9UHJ9 254 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPINA10Q9UK55 444 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa17.81■□□□□ 0.44
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SH3BP2-208ENST00000504294 LDHBP07195 334 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC37L1Q7L3B6 337 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA5Q8NB90 893 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 EXOC6Q8TAG9 804 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 DBNDD2Q9BQY9 259 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 NEFLP07196 543 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 SAMD7Q7Z3H4 446 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 CNTROBQ8N137 903 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 TEKT1Q969V4 418 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 SCN9AQ15858 1988 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 GSTO1P78417 241 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 RASGRF1Q13972 1273 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 ERICH6Q7L0X2 663 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 SULF1Q8IWU6 871 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 CERS5Q8N5B7 392 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 ARAP2Q8WZ64 1704 aa17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP2-208ENST00000504294 SCARF1Q14162 830 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 HHIPL2Q6UWX4 724 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 TRPM4Q8TD43 1214 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 MXD3Q9BW11 206 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 HMG20BQ9P0W2 317 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 F8W031 263 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFAIP1Q13829 316 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CFAP100Q494V2 611 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 LRP2BPQ9P2M1 347 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCF2Q9UG63 623 aa17.75■□□□□ 0.43
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