RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 SIL1Q9H173 461 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 WNT10BO00744 389 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 F8W031 263 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 GRM1Q13255 1194 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 VPS37DQ86XT2 251 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 CDCA5Q96FF9 252 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 CAPNS2Q96L46 248 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 CIAO1O76071 339 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 FGFR2P21802 821 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 FBXO3Q9UK99 471 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 ECE1P42892 770 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 HUNKP57058 714 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 SRGAP3O43295 1099 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 SLC5A1P13866 664 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 BCAMP50895 628 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 MTX1Q13505 466 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 DLGAP5Q15398 846 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 LPIN2Q92539 896 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 COPRSQ9NQ92 184 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 GNAI2P04899 355 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD11-202ENST00000498438 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 CFAP100Q494V2 611 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 AOC2O75106 756 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 RLBP1P12271 317 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 ATP2B3Q16720 1220 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 SPDYE6P0CI01 402 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 AIDAQ96BJ3 306 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 WBP1LQ9NX94 342 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 FOXN1O15353 648 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 AOX1Q06278 1338 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 GRIK5Q16478 980 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 CLRN2A0PK11 232 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 MYO1BO43795 1136 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 RGMBQ6NW40 437 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 MAP2K2P36507 400 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 FKBP1BP68106 108 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXD11-202ENST00000498438 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 VEZTQ9HBM0 779 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 ADORA1P30542 326 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 NF2P35240 595 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 CRKP46108 304 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 TFCP2Q12800 502 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 NOGQ13253 232 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 MOB2Q70IA6 237 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 PANK1Q8TE04 598 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 PHKA1P46020 1223 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 ZIC5Q96T25 663 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC102AQ96A19 550 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms