RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496314.1

TSC22D1-209, Transcript of TSC22 domain family member 1, human

TSL 2

Gene TSC22D1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC22D1-209	ENST00000496314	MICALL2	Q8IY33	904 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	DCTPP1	Q9H773	170 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	EPHX2	P34913	555 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314		H7C1D1	291 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	KIF3C	O14782	793 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314		F8W031	263 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	NEFL	P07196	543 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	DPF2	Q92785	391 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	SCN4A	P35499	1836 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		32.45	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	CERS5	Q8N5B7	392 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	USP17L8	P0C7I0	530 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	RASGRF1	Q13972	1273 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	GML	Q99445	158 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	SEMA3E	O15041	775 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	OGFOD1	Q8N543	542 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	IGHD	P01880	384 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	POTEI	P0CG38	1075 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	POTEJ	P0CG39	1038 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TSC22D1-209	ENST00000496314	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	PI16	Q6UXB8	463 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	GCC1	Q96CN9	775 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	SNRK	Q9NRH2	765 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	SCARF1	Q14162	830 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	EGFR	P00533	1210 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	GRIK5	Q16478	980 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	SPATA5	Q8NB90	893 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	MCAM	P43121	646 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	ABCF2	Q9UG63	623 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	TOMM70	O94826	608 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	32.34	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	LDHD	Q86WU2	507 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TSC22D1-209	ENST00000496314	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	PRDX5	P30044	214 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZAP70	P43403	619 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	DLGAP5	Q15398	846 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	CFAP100	Q494V2	611 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	CHADL	Q6NUI6	762 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	GPATCH3	Q96I76	525 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	MAST3	O60307	1309 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	SMC5	Q8IY18	1101 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
TSC22D1-209	ENST00000496314	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		32.27	■■■□□ 2.76

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