RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 F8W031 263 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 MAP2K2P36507 400 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 TNS4Q8IZW8 715 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 PDE8BO95263 885 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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PTPRU-207ENST00000492954 MEIS3Q99687 375 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 BCAR3O75815 825 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 DLGAP5Q15398 846 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 ZIC5Q96T25 663 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 EYA2O00167 538 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 NOGQ13253 232 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 VPS37DQ86XT2 251 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 TNNQ9UQP3 1299 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 CFAP100Q494V2 611 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 TRIM27P14373 513 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 FGFR2P21802 821 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 MOB2Q70IA6 237 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 SIL1Q9H173 461 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-207ENST00000492954 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.51■■□□□ 1.19
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PTPRU-207ENST00000492954 SPDYE6P0CI01 402 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 BCAMP50895 628 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 FKBP1BP68106 108 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC102AQ96A19 550 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 TSKSQ9UJT2 592 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 AOX1Q06278 1338 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 SLC10A3P09131 477 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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PTPRU-207ENST00000492954 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
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PTPRU-207ENST00000492954 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 GRIK5Q16478 980 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 LPIN2Q92539 896 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 MYO1BO43795 1136 aa22.47■■□□□ 1.19
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PTPRU-207ENST00000492954 SLC5A1P13866 664 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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PTPRU-207ENST00000492954 CA12O43570 354 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 VEZTQ9HBM0 779 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-207ENST00000492954 PRKG1Q13976 671 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 CAPN15O75808 1086 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 CRKP46108 304 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 ATP2B3Q16720 1220 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 COPRSQ9NQ92 184 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 FZD1Q9UP38 647 aa22.43■■□□□ 1.18
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