RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	CABP4	P57796	275 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	CBLL1	Q75N03	491 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	PIM2	Q9P1W9	311 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	WDR64	B1ANS9	1081 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	TRPA1	O75762	1119 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	DLGAP3	O95886	979 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	NLRP12	P59046	1061 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	6.65	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TTC3-222	ENST00000491952	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	NPR3	P17342	541 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	CES1	P23141	567 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	SGO2	Q562F6	1265 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	SHISA5	Q8N114	240 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	BSND	Q8WZ55	320 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	EDEM1	Q92611	657 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	PMEPA1	Q969W9	287 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	FOSL1	P15407	271 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	ATP2B4	P23634	1241 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	COL19A1	Q14993	1142 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	FDX2	Q6P4F2	183 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	ABI1	Q8IZP0	508 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	GATA6	Q92908	595 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952		A6NHS1	94 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	OSMR	Q99650	979 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	FAM177B	A6PVY3	158 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	EREG	O14944	169 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	TNFRSF21	O75509	655 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	ITGB5	P18084	799 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	ARL4D	P49703	201 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	IKBKE	Q14164	716 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	ADM	P35318	185 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	FZD5	Q13467	585 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTC3-222	ENST00000491952	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	MPST	P25325	297 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	ATG3	Q9NT62	314 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	EDN3	P14138	238 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	DRD2	P14416	443 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	PCSK2	P16519	638 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	ZAR1	Q86SH2	424 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	POLI	Q9UNA4	740 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	SSFA2	P28290	1259 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	FBXL18	Q96ME1	805 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	FZD6	O60353	706 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	JAG1	P78504	1218 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	C8orf34	Q49A92	452 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	OGFOD2	Q6N063	350 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	PAOX	Q6QHF9	649 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	FBXL6	Q8N531	539 aa		6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	PHACTR2	O75167	634 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TTC3-222	ENST00000491952	CTSB	P07858	339 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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