RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491491.1

MYCBP2-209, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene MYCBP2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-209	ENST00000491491	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	CCDC102B	Q68D86	513 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	HAUS7	Q99871	368 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	YDJC	A8MPS7	323 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	ATP2B4	P23634	1241 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	CXCL9	Q07325	125 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	EVI5L	Q96CN4	794 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	EYA3	Q99504	573 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	PHKA1	P46020	1223 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	DOK7	Q18PE1	504 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MYCBP2-209	ENST00000491491	RAD17	O75943	681 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	BCAM	P50895	628 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	CASC1	Q6TDU7	716 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	VPS37D	Q86XT2	251 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	POTEI	P0CG38	1075 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	POTEJ	P0CG39	1038 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	GYG1	P46976	350 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	HACL1	Q9UJ83	578 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	ECE2	O60344	883 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	SCNN1D	P51172	638 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	SCARF1	Q14162	830 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	SNRK	Q9NRH2	765 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	GOLIM4	O00461	696 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	KLRK1	P26718	216 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	EPHX2	P34913	555 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	MCAM	P43121	646 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	FSD1	Q9BTV5	496 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MYCBP2-209	ENST00000491491	AK9	Q5TCS8	1911 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	EPS15	P42566	896 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZAP70	P43403	619 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	FSTL1	Q12841	308 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	TNIP1	Q15025	636 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	SCN4A	P35499	1836 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	PSMD14	O00487	310 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	HSPA6	P17066	643 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	CHML	P26374	656 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	SPATA5	Q8NB90	893 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491		G3V3G9	751 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	HIP1	O00291	1037 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	RASGRF1	Q13972	1273 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	SEMA3E	O15041	775 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	PI16	Q6UXB8	463 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	MED23	Q9ULK4	1368 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MYCBP2-209	ENST00000491491	TICAM2	Q86XR7	235 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	SCN9A	Q15858	1988 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	SHTN1	A0MZ66	631 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	SEC24B	O95487	1268 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	CHADL	Q6NUI6	762 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	LDHD	Q86WU2	507 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZBTB22	O15209	634 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MYCBP2-209	ENST00000491491	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		28.73	■■■□□ 2.19

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