RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 PLIN1O60240 522 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 CLRN2A0PK11 232 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 FKTNO75072 461 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 CFAP100Q494V2 611 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 BEND3Q5T5X7 828 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 AOX1Q06278 1338 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 IL1R1P14778 569 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 VEZTQ9HBM0 779 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 WDR63Q8IWG1 891 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 MRS2Q9HD23 443 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-217ENST00000489650 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 MAP3K11Q16584 847 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 IFNL1Q8IU54 200 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 WNK4Q96J92 1243 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 MYO1BO43795 1136 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 SPDYE6P0CI01 402 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 GRM8O00222 908 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 ALDH1A1P00352 501 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 INHBEP58166 350 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 RASA3Q14644 834 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 TRIM17Q9Y577 477 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 GJA5P36382 358 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 GYG1P46976 350 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRN-217ENST00000489650 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 CENPFP49454 3210 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 SUCLG2Q96I99 432 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 HTTP42858 3142 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 ELP3Q9H9T3 547 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 LAMB1P07942 1786 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 UNCXA6NJT0 531 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 ALDH1L1O75891 902 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 CRHR2Q13324 411 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 UBE4AQ14139 1066 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 KAZALD1Q96I82 304 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 PTPN18Q99952 460 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 OTOFQ9HC10 1997 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 GRIK5Q16478 980 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 ANP32CO43423 234 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 OPTNQ96CV9 577 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-217ENST00000489650 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 POTEFA5A3E0 1075 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 TNFAIP1Q13829 316 aa23.32■■□□□ 1.32
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