RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489356.1

FGD2-208, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene FGD2, Length 1,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD2-208ENST00000489356 MMP14P50281 582 aa22.1■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 DLGAP5Q15398 846 aa22.1■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 VPS37DQ86XT2 251 aa22.1■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.1■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 ZIC5Q96T25 663 aa22.08■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 TSKSQ9UJT2 592 aa22.08■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 NOGQ13253 232 aa22.07■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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FGD2-208ENST00000489356 CCDC102AQ96A19 550 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 A0A1B0GUL6 1792 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 PDE8BO95263 885 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 NF2P35240 595 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 CFAP100Q494V2 611 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 MOB2Q70IA6 237 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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FGD2-208ENST00000489356 SIL1Q9H173 461 aa22.05■■□□□ 1.12
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FGD2-208ENST00000489356 PRKG1Q13976 671 aa22.04■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.04■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 CLRN2A0PK11 232 aa22.03■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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FGD2-208ENST00000489356 FKBP1BP68106 108 aa22.03■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FGD2-208ENST00000489356 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.03■■□□□ 1.12
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FGD2-208ENST00000489356 MEIS3Q99687 375 aa22.03■■□□□ 1.12
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FGD2-208ENST00000489356 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.02■■□□□ 1.12
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FGD2-208ENST00000489356 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22■■□□□ 1.11
FGD2-208ENST00000489356 SLC10A3P09131 477 aa22■■□□□ 1.11
FGD2-208ENST00000489356 SPDYE6P0CI01 402 aa22■■□□□ 1.11
FGD2-208ENST00000489356 DEFB129Q9H1M3 183 aa22■■□□□ 1.11
FGD2-208ENST00000489356 CA12O43570 354 aa21.99■■□□□ 1.11
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FGD2-208ENST00000489356 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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FGD2-208ENST00000489356 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.98■■□□□ 1.11
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FGD2-208ENST00000489356 ATP2B3Q16720 1220 aa21.95■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 FBXO3Q9UK99 471 aa21.95■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 TRPA1O75762 1119 aa21.94■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 SRGAP3O43295 1099 aa21.93■■□□□ 1.1
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