RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487621.5

SEMA3C-209, Transcript of semaphorin 3C, human

TSL 5

Gene SEMA3C, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3C-209	ENST00000487621	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SEMA3C-209	ENST00000487621	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	SLC10A3	P09131	477 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	MOB2	Q70IA6	237 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	LRRC24	Q50LG9	513 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	JAG2	Q9Y219	1238 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	GYG1	P46976	350 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
SEMA3C-209	ENST00000487621	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	DLGAP5	Q15398	846 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621		F8W031	263 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	CFAP100	Q494V2	611 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	CSRNP1	Q96S65	589 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	SPDYE6	P0CI01	402 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	AOX1	Q06278	1338 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	PDE8B	O95263	885 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	METTL24	Q5JXM2	366 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	ABHD8	Q96I13	439 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	RNF186	Q9NXI6	227 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SEMA3C-209	ENST00000487621	NF2	P35240	595 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	FGFR2	P21802	821 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	CLRN2	A0PK11	232 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	EYA2	O00167	538 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	TRPA1	O75762	1119 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
SEMA3C-209	ENST00000487621	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	MYO1B	O43795	1136 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	GRIK5	Q16478	980 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	FZD1	Q9UP38	647 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	PRKG1	Q13976	671 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	MAP3K11	Q16584	847 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	BCAM	P50895	628 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	VPS37D	Q86XT2	251 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	31.04	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	VEZT	Q9HBM0	779 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	CRK	P46108	304 aa		31.02	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	TM4SF4	P48230	202 aa		31.02	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		31.02	■■■□□ 2.56
SEMA3C-209	ENST00000487621	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	RASA3	Q14644	834 aa		31.01	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		31.01	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	MEIS3	Q99687	375 aa		31.01	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	FBXO3	Q9UK99	471 aa		31.01	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	31	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	CIAO1	O76071	339 aa		30.99	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	30.99	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	30.99	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		30.99	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	SPRYD7	Q5W111	196 aa		30.99	■■■□□ 2.55
SEMA3C-209	ENST00000487621	LPIN2	Q92539	896 aa		30.99	■■■□□ 2.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms