RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 PHKA1P46020 1223 aa20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 GTF2IP78347 998 aa20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 VPS37DQ86XT2 251 aa20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 EPHX2P34913 555 aa20.4■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 CERS5Q8N5B7 392 aa20.4■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.4■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HCLS1-208ENST00000487290 EPS15P42566 896 aa20.39■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.39■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 MICALL2Q8IY33 904 aa20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 DOCK2Q92608 1830 aa20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 RASGRF1Q13972 1273 aa20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 TOMM70O94826 608 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 USP17L8P0C7I0 530 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 GCC1Q96CN9 775 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 MXD3Q9BW11 206 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 SHTN1A0MZ66 631 aa20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 H7C1D1 291 aa20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 IGSF3O75054 1194 aa20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 LDHDQ86WU2 507 aa20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 SMC5Q8IY18 1101 aa20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 AACSQ86V21 672 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 MRIQ9BWK5 157 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 MCAMP43121 646 aa20.33■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.33■□□□□ 0.85
HCLS1-208ENST00000487290 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 EGFRP00533 1210 aa20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 FBXW7Q969H0 707 aa20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 MAST3O60307 1309 aa20.31■□□□□ 0.84
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HCLS1-208ENST00000487290 POTEJP0CG39 1038 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 FSTL1Q12841 308 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 SCARF1Q14162 830 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 GORABQ5T7V8 394 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 OGFOD1Q8N543 542 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 SPATA5Q8NB90 893 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 JAG2Q9Y219 1238 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 GRIK5Q16478 980 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 IGHDP01880 384 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 CHADLQ6NUI6 762 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 APBB1O00213 710 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 PI16Q6UXB8 463 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-208ENST00000487290 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.27■□□□□ 0.84
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