RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 UTYO14607 1347 aa27.19■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.19■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 PTPRCP08575 1304 aa27.18■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.17■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 MMP14P50281 582 aa27.17■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 DLGAP5Q15398 846 aa27.17■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.17■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 TRPA1O75762 1119 aa27.16■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 GYG1P46976 350 aa27.16■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 PRKG1Q13976 671 aa27.16■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 CSRNP1Q96S65 589 aa27.16■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 NF2P35240 595 aa27.15■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 RNF186Q9NXI6 227 aa27.15■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 UBE4AQ14139 1066 aa27.14■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
USP40-215ENST00000484528 CLRN2A0PK11 232 aa27.13■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 CFAP100Q494V2 611 aa27.13■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 LRRC24Q50LG9 513 aa27.13■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 MCOLN1Q9GZU1 580 aa27.13■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.13■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 SAGE1Q9NXZ1 904 aa27.13■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 FZD1Q9UP38 647 aa27.13■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.13■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 AOX1Q06278 1338 aa27.13■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.12■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 MTMR14Q8NCE2 650 aa27.11■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 USP44Q9H0E7 712 aa27.11■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.11■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 SPDYE2BA6NHP3 402 aa27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 CCDC85CA6NKD9 419 aa27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 SPDYE6P0CI01 402 aa27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 DGKZQ13574 1117 aa27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 METTL24Q5JXM2 366 aa27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 MFSD14BQ5SR56 506 aa27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.1■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 VEZTQ9HBM0 779 aa27.09■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 SSC5DA1L4H1 1573 aa27.09■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 ARMC9Q7Z3E5 817 aa27.08■■□□□ 1.93
USP40-215ENST00000484528 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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USP40-215ENST00000484528 MYO1BO43795 1136 aa27.07■■□□□ 1.92
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USP40-215ENST00000484528 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.07■■□□□ 1.92
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USP40-215ENST00000484528 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.05■■□□□ 1.92
USP40-215ENST00000484528 PDE8BO95263 885 aa27.03■■□□□ 1.92
USP40-215ENST00000484528 GRIK5Q16478 980 aa27.03■■□□□ 1.92
USP40-215ENST00000484528 FBXO33Q7Z6M2 555 aa27.03■■□□□ 1.92
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USP40-215ENST00000484528 CCER2I3L3R5 266 aa27.02■■□□□ 1.92
USP40-215ENST00000484528 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.02■■□□□ 1.92
USP40-215ENST00000484528 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
USP40-215ENST00000484528 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa27.02■■□□□ 1.92
USP40-215ENST00000484528 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 CAVIN4Q5BKX8 364 aa27.01■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 TBC1D8O95759 1140 aa27■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 BCAMP50895 628 aa27■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 RASA3Q14644 834 aa27■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 CLMNQ96JQ2 1002 aa27■■□□□ 1.91
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USP40-215ENST00000484528 SERPINA10Q9UK55 444 aa27■■□□□ 1.91
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USP40-215ENST00000484528 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.99■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 EYA2O00167 538 aa26.98■■□□□ 1.91
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USP40-215ENST00000484528 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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USP40-215ENST00000484528 TM4SF4P48230 202 aa26.97■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.97■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.97■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 SIL1Q9H173 461 aa26.97■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 FGFR2P21802 821 aa26.96■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 SREBF2Q12772 1141 aa26.96■■□□□ 1.91
USP40-215ENST00000484528 MAP3K11Q16584 847 aa26.96■■□□□ 1.91
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