RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP8B2P98198 1209 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP2B3Q16720 1220 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 USP48Q86UV5 1035 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 BCAMP50895 628 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 KLRG1Q96E93 195 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
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SH3BP4-209ENST00000484097 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 SULF1Q8IWU6 871 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 GGA3Q9NZ52 723 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 CERS5Q8N5B7 392 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
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SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 COG6Q9Y2V7 657 aa23.88■■□□□ 1.41
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SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 WNT10BO00744 389 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 TFCP2Q12800 502 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 POLA2Q14181 598 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 SSH3Q8TE77 659 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.413e-6■■□□□ 14.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CST9Q5W186 159 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 ADM5C9JUS6 153 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 TIMM10P62072 90 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 PDE3AQ14432 1141 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 CFAP100Q494V2 611 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1B0GUL7 405 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 MYO1BO43795 1136 aa23.82■■□□□ 1.4
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SH3BP4-209ENST00000484097 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 CNTNAP1P78357 1384 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 GORABQ5T7V8 394 aa23.81■■□□□ 1.4
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SH3BP4-209ENST00000484097 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 ADORA1P30542 326 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 PHKA1P46020 1223 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC102BQ68D86 513 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 XAGE2Q96GT9 111 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 RASSF10A6NK89 507 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 SEMA3EO15041 775 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 CDCA5Q96FF9 252 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 JMYQ8N9B5 988 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 SPDYE6P0CI01 402 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 CRKP46108 304 aa23.77■■□□□ 1.4
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SH3BP4-209ENST00000484097 MAST3O60307 1309 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4-209ENST00000484097 HMMRO75330 724 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ECE1P42892 770 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 VEGFBP49765 207 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR108Q9NPR9 543 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CEP350Q5VT06 3117 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 NF2P35240 595 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 GRIK5Q16478 980 aa23.75■■□□□ 1.39
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