RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481958.1

APOBEC3G-205, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, human

TSL 2

Gene APOBEC3G, Length 2,337 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ALDH1B1	P30837	517 aa		18.92	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	SP8	Q8IXZ3	490 aa		18.92	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	FAM227B	Q96M60	508 aa		18.92	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		18.92	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	KCNJ4	P48050	445 aa		18.92	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	PDE4C	Q08493	712 aa		18.92	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	18.92	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	STYK1	Q6J9G0	422 aa		18.91	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.91	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	FSD1	Q9BTV5	496 aa		18.91	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		18.91	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		18.91	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		18.91	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	CHD4	Q14839	1912 aa		18.91	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	UFL1	O94874	794 aa		18.9	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		18.9	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958		A0A0D9SFI3	127 aa		18.9	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	OFD1	O75665	1012 aa		18.9	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
APOBEC3G-205	ENST00000481958	PTMS	P20962	102 aa		18.89	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	SPATA5	Q8NB90	893 aa		18.89	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		18.89	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		18.89	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		18.89	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	POLD1	P28340	1107 aa		18.89	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.89	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	MYH7	P12883	1935 aa		18.88	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	GGA1	Q9UJY5	639 aa		18.88	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	SNED1	Q8TER0	1413 aa		18.88	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		18.87	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	DOCK2	Q92608	1830 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	C6orf229	H3BNL8	230 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	SGSM2	O43147	1006 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	KLHL34	Q8N239	644 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	C21orf2	O43822	256 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	TMC4	Q7Z404	712 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	MPND	Q8N594	471 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	CNKSR1	Q969H4	720 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		18.86	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ATP2B4	P23634	1241 aa		18.85	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		18.85	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	USP26	Q9BXU7	913 aa		18.85	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	RIMBP2	O15034	1052 aa		18.85	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		18.85	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		18.85	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	CASC1	Q6TDU7	716 aa		18.84	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		18.84	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	TTLL6	Q8N841	843 aa		18.84	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		18.84	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	PTH1R	Q03431	593 aa		18.83	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		18.83	■□□□□ 0.61
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ZNF384	Q8TF68	577 aa		18.83	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	OSBP2	Q969R2	916 aa		18.83	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	TGFB2	P61812	414 aa		18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	GRIK5	Q16478	980 aa		18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	CD209	Q9NNX6	404 aa		18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	WASHC4	Q2M389	1173 aa		18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	MED23	Q9ULK4	1368 aa		18.81	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958		M0R2C6	588 aa		18.81	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		18.81	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	KIF2C	Q99661	725 aa		18.81	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ABCF2	Q9UG63	623 aa		18.81	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	DOK7	Q18PE1	504 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	SCN9A	Q15858	1988 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	ADD2	P35612	726 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	HS1BP3	Q53T59	392 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	MAST3	O60307	1309 aa		18.8	■□□□□ 0.6
APOBEC3G-205	ENST00000481958	PRDX5	P30044	214 aa		18.79	■□□□□ 0.6

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