RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478021.1

TRAF4-211, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 718 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-211ENST00000478021 F8W031 263 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 SASH1O94885 1247 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 BCAMP50895 628 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 CNTNAP1P78357 1384 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 SLC5A1P13866 664 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 LPIN2Q92539 896 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAF4-211ENST00000478021 WNT10BO00744 389 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 ATP2B3Q16720 1220 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 SULF1Q8IWU6 871 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.25■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 JMYQ8N9B5 988 aa28.25■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 RASSF10A6NK89 507 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 MMP14P50281 582 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 TFCP2Q12800 502 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.21■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.21■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 VEGFBP49765 207 aa28.21■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 DLGAP5Q15398 846 aa28.21■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 IFFO2Q5TF58 517 aa28.21■■■□□ 2.11
TRAF4-211ENST00000478021 MS4A1P11836 297 aa28.2■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 ATP8B2P98198 1209 aa28.2■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 CFAP100Q494V2 611 aa28.2■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 CDCA5Q96FF9 252 aa28.2■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 ADORA1P30542 326 aa28.19■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 GRIK5Q16478 980 aa28.19■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 COG6Q9Y2V7 657 aa28.19■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 GRM1Q13255 1194 aa28.18■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 POLA2Q14181 598 aa28.18■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 TIMM10P62072 90 aa28.17■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.17■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 SAPCD2Q86UD0 394 aa28.17■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 SSH3Q8TE77 659 aa28.17■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 PHKA1P46020 1223 aa28.16■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.16■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.16■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.16■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 AOX1Q06278 1338 aa28.16■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 A0A1B0GUL7 405 aa28.15■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.15■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 CLRN2A0PK11 232 aa28.14■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.14■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 SPDYE6P0CI01 402 aa28.14■■■□□ 2.1
TRAF4-211ENST00000478021 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 CCDC102BQ68D86 513 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 CEP85Q6P2H3 762 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 CAPNS2Q96L46 248 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 HUNKP57058 714 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 XAGE2Q96GT9 111 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 PCNTO95613 3336 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 MYO1BO43795 1136 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 CRKP46108 304 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 VEZTQ9HBM0 779 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 ECE1P42892 770 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TRAF4-211ENST00000478021 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.1■■■□□ 2.09
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