RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 LTBP1Q14766 1721 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 NRXN2Q9P2S2 1712 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 MYH13Q9UKX3 1938 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 M0R2C6 588 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 SOCS7O14512 581 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 RPS6KA4O75676 772 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 SPOCK2Q92563 424 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 GBP4Q96PP9 640 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 EVCP57679 992 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 KRT32Q14532 448 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 ZMYM6O95789 1325 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 EP400Q96L91 3159 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 G3V3G9 751 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 PSMA5P28066 241 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 ADD2P35612 726 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 PHKA1P46020 1223 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 UBE3CQ15386 1083 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 RNF20Q5VTR2 975 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 MTMR6Q9Y217 621 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 SYT1P21579 422 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 TM4SF1P30408 202 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 ERFEQ4G0M1 354 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.74□□□□□ -1.33
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