RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 CYP4F22Q6NT55 531 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-202ENST00000460160 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-202ENST00000460160 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-202ENST00000460160 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-202ENST00000460160 CAPNS2Q96L46 248 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-202ENST00000460160 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-202ENST00000460160 GNAI3P08754 354 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO33Q7Z6M2 555 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 CDCA5Q96FF9 252 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 HHIPL1Q96JK4 782 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 SIL1Q9H173 461 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 FGFR2P21802 821 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 ECE1P42892 770 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 GRM1Q13255 1194 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO3Q9UK99 471 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 ECM29Q5VYK3 1845 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 F8W031 263 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 CIAO1O76071 339 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 VPS37DQ86XT2 251 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 HUNKP57058 714 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 CAVIN4Q5BKX8 364 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 MTMR14Q8NCE2 650 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 COPRSQ9NQ92 184 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 WBP1LQ9NX94 342 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 BCAMP50895 628 aa29.51■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 C2orf69Q8N8R5 385 aa29.51■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa29.51■■■□□ 2.32
HOXB3-202ENST00000460160 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 MTX1Q13505 466 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 DLGAP5Q15398 846 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 MYH13Q9UKX3 1938 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 LPIN2Q92539 896 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 FOXN1O15353 648 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 AOC2O75106 756 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 SLC5A1P13866 664 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 CFAP100Q494V2 611 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 SRGAP3O43295 1099 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 GNAI2P04899 355 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 SPDYE6P0CI01 402 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
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HOXB3-202ENST00000460160 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
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HOXB3-202ENST00000460160 RLBP1P12271 317 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 MAP2K2P36507 400 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 ATP2B3Q16720 1220 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 AIDAQ96BJ3 306 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 AOX1Q06278 1338 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXB3-202ENST00000460160 GRIK5Q16478 980 aa29.45■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 RGMBQ6NW40 437 aa29.45■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 FKBP1BP68106 108 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINA10Q9UK55 444 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 CLRN2A0PK11 232 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 MYO1BO43795 1136 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 ZIC5Q96T25 663 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 NOGQ13253 232 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 MOB2Q70IA6 237 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 DEFB129Q9H1M3 183 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 CRKP46108 304 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC102AQ96A19 550 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 ADORA1P30542 326 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 NF2P35240 595 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 TFCP2Q12800 502 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 VEZTQ9HBM0 779 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 SLC10A3P09131 477 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 PHKA1P46020 1223 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-202ENST00000460160 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
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