RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BEND3Q5T5X7 828 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARAP2Q8WZ64 1704 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GPR25O00155 361 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ALDH1A1P00352 501 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPRYD7Q5W111 196 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF804AQ7Z570 1209 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CERS5Q8N5B7 392 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HPS5Q9UPZ3 1129 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TAF5LO75529 589 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SOX10P56693 466 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SSC5DA1L4H1 1573 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OTOFQ9HC10 1997 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPDYE2BA6NHP3 402 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SNAP23O00161 211 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYO1BO43795 1136 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPDYE6P0CI01 402 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM205AQ6ZU69 1335 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 F6X3S4 739 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GRM8O00222 908 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FKTNO75072 461 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ALDH1L1O75891 902 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CFAP100Q494V2 611 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC10A4Q96EP9 437 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MRS2Q9HD23 443 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRKG1Q13976 671 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE4AQ14139 1066 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IFNL1Q8IU54 200 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WNK4Q96J92 1243 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CNNM1Q9NRU3 951 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SERPINA10Q9UK55 444 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHMP3Q9Y3E7 222 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UTYO14607 1347 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP2O75604 605 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IREB2P48200 963 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TNFAIP1Q13829 316 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPDYE2Q495Y8 402 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TAF7LQ5H9L4 462 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CLMNQ96JQ2 1002 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CLRN2A0PK11 232 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 F8W031 263 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANP32CO43423 234 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RASA3Q14644 834 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FZD1Q9UP38 647 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYH13Q9UKX3 1938 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AOX1Q06278 1338 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MROH5Q6ZUA9 1318 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MFSD14BQ5SR56 506 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KAZALD1Q96I82 304 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VEZTQ9HBM0 779 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLIN1O60240 522 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TEPSINQ96N21 525 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GJA5P36382 358 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GYG1P46976 350 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC4A10Q6U841 1118 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OTOP1Q7RTM1 612 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FBXO33Q7Z6M2 555 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ERO1AQ96HE7 468 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SUCLG2Q96I99 432 aa12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms