RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 GYG1P46976 350 aa30.1■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 METTL24Q5JXM2 366 aa30.1■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 RGMBQ6NW40 437 aa30.1■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 PDE8BO95263 885 aa30.09■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM205AQ6ZU69 1335 aa30.09■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 VGLL2Q8N8G2 317 aa30.09■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 LBX1P52954 281 aa30.08■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.08■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 BEGAINQ9BUH8 593 aa30.08■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 JAG2Q9Y219 1238 aa30.08■■■□□ 2.41
PPP1CB-208ENST00000455580 NOGQ13253 232 aa30.07■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 FBXO33Q7Z6M2 555 aa30.07■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF16BQ96L93 1317 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 FKBP1BP68106 108 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 DLGAP5Q15398 846 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC102AQ96A19 550 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 F8W031 263 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 ZIC5Q96T25 663 aa30.05■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 HDAC5Q9UQL6 1122 aa30.05■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 EYA2O00167 538 aa30.04■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 FGFR2P21802 821 aa30.02■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 CFAP100Q494V2 611 aa30.02■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 CAVIN4Q5BKX8 364 aa30.02■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.02■■■□□ 2.4
PPP1CB-208ENST00000455580 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 BCAR3O75815 825 aa30.01■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 MFSD14BQ5SR56 506 aa30.01■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 VPS37DQ86XT2 251 aa30.01■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 MEIS3Q99687 375 aa30.01■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 ATG9AQ7Z3C6 839 aa30■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 FBXO3Q9UK99 471 aa30■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.99■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 CA12O43570 354 aa29.99■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC10A3P09131 477 aa29.99■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 SPDYE6P0CI01 402 aa29.99■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 MOB2Q70IA6 237 aa29.99■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 NF2P35240 595 aa29.98■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 BCAMP50895 628 aa29.98■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.97■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM27P14373 513 aa29.97■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.97■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 DEFB129Q9H1M3 183 aa29.97■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.97■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 MYO1BO43795 1136 aa29.96■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 CIAO1O76071 339 aa29.96■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 GNAI3P08754 354 aa29.96■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 LPIN2Q92539 896 aa29.96■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 SIL1Q9H173 461 aa29.95■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 TSKSQ9UJT2 592 aa29.95■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 SERPINA10Q9UK55 444 aa29.95■■■□□ 2.39
PPP1CB-208ENST00000455580 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 TNNQ9UQP3 1299 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 AOX1Q06278 1338 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 CLRN2A0PK11 232 aa29.93■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC5A1P13866 664 aa29.93■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 COPRSQ9NQ92 184 aa29.93■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.93■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.93■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 GRIK5Q16478 980 aa29.92■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 CSRNP1Q96S65 589 aa29.92■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.91■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 CRKP46108 304 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 VEZTQ9HBM0 779 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 MTX1Q13505 466 aa29.89■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 PRKG1Q13976 671 aa29.89■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PPP1CB-208ENST00000455580 ATP2B3Q16720 1220 aa29.88■■■□□ 2.37
PPP1CB-208ENST00000455580 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.88■■■□□ 2.37
PPP1CB-208ENST00000455580 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms